当時土崎には諸国の舟も人も集り、繁栄に向かっていたので、総町へ相談し、藩主の許可を得て、湊城跡に土崎総鎮守として、社殿を建立する。

　旧藩主佐竹家においても、格別崇敬し、当港糶米100石の税を以て当社の諸費に充てた。

　明治14年県社に列せられる。

　平成9年、国重要無形民俗文化財（土崎神明社祭の曳山行事）に指定される。